Ancestry.com が顧客の DNA を使って 19 世紀のカップルのゲノムを再構築

デイビッド・スピーグルは1800年代にアラバマ州で説教をしていた人物です。彼は聖書の「産めよ、増えよ」という教えを非常に真剣に受け止めていたようです。彼には26人の子供と150人以上の孫がいました。そこから子孫の数は増えていきました。今日、米国にはスピーグルの子孫が非常に多く、人気の家族歴史ウェブサイトであるAncestry.comは、顧客からのデータのみを使用してスピーグルとその配偶者のゲノムの大部分を再構築することができました。

Ancestry.com の遺伝学者は、スピーグルとその 2 人の妻の DNA を再構築し、1 人の人物に含まれると予想される遺伝子の約 50% を発見したと、同社が本日発表しました。この再構築プロジェクトは、スピーグルとその妻の髪の毛やその他の部分を一切採取することなく、200 年前に生きていた人々の生態を垣間見ることができるものです。とてもすばらしいことです。このプロジェクトは、Ancestry.com が所有する家系図と DNA サンプルの総合的な力も示しています。

「私たちのデータベースには50万を超える遺伝子型サンプルがあり、そのサンプルの多く、あるいはほとんどは、多くの人が何年もかけて構築してきた巨大な家系図と関連しています」と、Ancestry.comのゲノム担当副社長キャサリン・ボール氏はポピュラーサイエンス誌に語った。Ancestry.comのユーザーがサイトを使用する際にアップロードするそのデータは、再構築プロジェクトにとって非常に重要だった。

「彼らは素晴らしいデータベースを持っているので、おそらく比較的正確でしょう。」

「彼らは素晴らしいデータベースを持っているので、おそらく比較的正確でしょう」と、このウェブサイトには勤務していないストーニーブルック大学の集団遺伝学者、ブレンナ・ヘン氏は言う。「顧客にとっては確かに素晴らしいことです。」

Ancestry.com の利用者は、まず両親や祖父母の名前や生年月日など、家系図のわかっている部分を入力するところから始めます。そこから、サイトのアルゴリズムは出生証明書、移民フォーム、その他の公式記録の独自のデータベースを使用して、利用者が家系図のこれまでわからなかったメンバーを入力するのを手伝います。さらに 100 ドル支払うと、利用者は唾液サンプルを Ancestry.com に送って DNA 配列を調べることができます。Ancestry.com は DNA を使用して、利用者の民族的起源を知らせ、さらに利用者の家系図に情報を入力します。

スピーグルとその妻たちのゲノムを再構築するため、Ancestry.com の遺伝学者たちは、同サイトの家系図を使って、唾を送ってきた顧客で、最後の共通祖先がスピーグルである顧客を探した。それらの顧客の DNA が互いに同一の長い領域を持っていたときはいつでも、遺伝学者たちは、その領域はスピーグルと彼の妻のどちらか、つまり最初の妻ウィニフレッドか、ウィニフレッドの死後に結婚したナンシーのどちらかのものであるに違いないとわかった。遺伝学者たちはまた、スピーグル家系図全体を調べ、ツリー全体で共通する遺伝子を探した。

同社は今日、Ancestry.com の顧客であるスピーグルの子孫にこのプロジェクトについて知らせたと、同社の広報担当メリッサ・ギャレットは言う。しかし、Ancestry.com は他のユーザーのために同じプロジェクトを再度実施する予定はない。「私たちは概念実証として再構築を試みることにしたのです」とボールは言う。同社がそれが可能であることがわかった今、新しい DNA 再構築技術をテストしたい場合を除いて、再度行うことはないだろう。